Pada dua musim pertama, Indonesia's Got Talent menggunakan format yang sama dengan Britain's Got Talent yang terdiri atas empat babak utama, iaitu uji bakat, pemilihan juri, separuh akhir dan akhir.

Pada musim ketiga, Indonesia's Got Talent mengguna pakai format America's Got Talent pula yang terdiri atas lima babak utama: uji bakat, pemilihan juri, suku akhir, separuh akhir dan akhir.

Uji bakat

Peserta yang berhak mengikuti uji bakat Indonesia's Got Talent disaring melalui uji bakat awal yang diselenggarakan pihak stesen televisyen, baik dalam atau luar talian. Peserta terpilih kemudian menjalani perakaman audisi di sebuah tempat tertentu dan akan diberi komen oleh para juri. Selama sesi uji bakat, setiap juri berhak menekan butang merah (Red Buzzer) dengan simbol "X" yang menandakan juri tersebut tidak menyukai aksi yang ditampilkan apabila Red Buzzer seluruhnya menyala, penampilan peserta secara automatik berhenti. Meskipun begitu, sistem butang ini belum menjamin kelayakan peserta ke babak selanjutnya. Peserta disahkan layak jika mendapatkan minimum 3 "ya" dari para juri. Namun, ketika 3 juri mengatakan "tidak" atau keputusan seimbang dari para juri (2 "ya" dan 2 "tidak"), maka peserta gagal layak.

Sejak musim kedua, terdapat penerapan berupa Golden Buzzer, yang berhak untuk diberikan oleh salah satu juri. Peserta yang memperoleh ini akan automatik ke separuh akhir tanpa melalui babak pemilihan awal. Butang ini sekali gus menyelamatkan peserta apabila penampilan peserta tersebut tidak disukai sebahagian besar juri.

Pemilihan juri

Babak ini ialah lanjutan sesi uji bakat, bernama Judge Choice pada musim pertama, di mana aksi yang telah persembahan pada babak dalam uji bakat akan berhadapan langsung dengan juri, dan ditentukan nasibnya, sama ada layak atau tidak.

Pada musim kedua, babak ini diulang dengan nama Judge Cull, dimana para juri akan berkeputusan untuk melayakkan peserta yang menurut mereka layak untuk merebut hati mereka serta penonton melalui undian.

Pada musim ketiga, babak ini dinamakan semula sebagai Judge Cuts, di mana peserta dari uji bakat akan kembali menampilkan bakatnya di hadapan para juri. Babak ini akan menjadi penentuan ada aksi tersebut berhak persembahan ke suku akhir atau tidak.

Suku akhir

Babak suku akhir mula dipakai pada musim ketiga. Pada babak ini, para peserta yang layak akan kembali persembahan untuk merebut hati para juri sekali lagi dengan bakat mereka. Peserta yang dapat menarik perhatian juri pantas mara ke separuh akhir.

Separuh akhir

Babak Separa-Final bermula dari musim pertama. Dalam pusingan ini, para peserta akan menampilkan bakatnya secara langsung kepada juri dan penonton. Pada musim kedua, format babak Separa-Final ini berubah; dalam musim ini, babak ini diikuti oleh peserta yang layak melalui Golden Buzzer ketika uji bakat.

Namun, pada musim ketiga, format ini kembali mengalami perubahan. Peserta dari suku akhir serta Golden Buzzer akan berlaga untuk memperebutkan tempat di pusingan akhir. Nasib mereka tertakluk kepada undian penonton, sama ada mereka layak ke pusingan akhir atau tidak.

Akhir

Road to Grand Final

Pada musim ketiga, sebelum memasuki babak Grand Final, terdapat satu babak tambahan, iaitu Road to Grand Final. Dalam pusingan ini ini, para peserta akan melakukan persembahan untuk mendapatkan undian dari para penonton seluruh Indonesia; Hanya 5 peserta dengan undian tertinggi yang akan melangkah ke babak Grand Final.

Grand Final

Di babak akhir acara ini, seluruh peserta yang melayakkan babak Road to Grand Final akan menampilkan bakat mereka buat kali terakhir. Penentuan juara di babak ini adalah lebih kurang sama seperti babak sebelumnya, iaitu melalui hasil undian penonton. Juara akan mendapatkan hadiah sesuai ketetapan penganjur.